水经过加热后形成水垢，其主要成分是硬度垢，也就是钙、镁离子垢。水经过旁流水处理器，在脉冲低压电场作用下使水分子排列有序，使其成垢离子间的排列顺序发生变化，阻止钙镁离子形成晶核，进而达到防垢除垢的目的。 实践和研究证明，设备及金属管道内壁在介质为0~90℃的水中，腐蚀的主要方式是电化学腐蚀（微电池效应），次要方式是氧腐蚀和热腐蚀等。因此，控制电化学腐蚀就成了消除黄锈水现象、控制管网腐蚀的主要办法。旁流水处理器在不改变水的生化属性的前提下，通过脉冲低压电场改变了水分子的排列顺序，大大降低了电导率，使电化学腐蚀的通路受到抑制；另外，改变了金属与非金属离子间的电位差，也使腐蚀减弱，在完全无污染的情况下，从根本上达到了根治腐蚀、消除黄锈水的目的 水中菌藻生殖繁殖需要一定的环境，旁流水处理器是利用脉冲低压电场来破坏细菌的细胞表面、破坏细菌的活性酶系统，停止其新陈代谢，使细菌生存环境改变，从而达到杀菌灭藻的目的。